Стратегическите предизвикателства пред съвременните Балкани произтичат от процеси и политики, които определят степента на сигурност в отделните държави и в регионален план. Повлияват се управлението на латентни и активни конфликти от различно естество – етнически, религиозни, икономически и политически – вътре в балканските държави или между тях. Сигурността и стабилността в съвременните Балкани са в пряка зависимост и от намесата на външни фактори (национални държави, интеграционни общности и международни организации).